Você pode usar um script vbs. Isto irá lançar o bloco de notas se você disser que sim e notificá-lo que você bateu cancelar (se você clicar em cancelar).
Set WshShell = CreateObject("WScript.Shell")
intButton = WshShell.Popup ("Hey, this software might be running on another computer, are you sure you want to start it here?", , , 1 + 48)
select case intButton
case 1
strMessage = ""
sub shell(cmd)
WshShell.Run(cmd)
Set WshShell = Nothing
end sub
shell """C:\Program Files (x86)\UltraISO\UltraISO.exe"""
case 2
strMessage = "You clicked the Cancel button."
WshShell.Popup strMessage, , , 32
end select
Basta copiar / colar em um arquivo de texto e alterar o texto para um vbs.