Você pode editar essas entradas no registro. Eu pessoalmente nunca consigo lembrar onde os comandos de execução estão armazenados, então eu uso o Painel de Controle de Inicialização . Você pode obtê-lo como um snap-in do painel de controle ou como um exe autônomo. De qualquer forma, ele mostrará todos os itens em execução na inicialização (pasta de inicialização para você, para o sistema e todos os locais do registro). Você pode então clicar no que quiser, selecionar editar e adicionar um parâmetro de linha de comando depois dele.