Depois de tentar alguns botões no editor de partições do MiniTool (qualquer outra ferramenta como EaseUS ou Testdisk funcionaria), vi que a partição tinha seu campo "ID do Tipo de Partição" definido como 0x0B (FAT32). Eu tentei defini-lo para 0x0C (FAT32 LBA) e imediatamente após aplicar as alterações, a unidade apareceu no Windows Explorer como FAT32 e tudo estava funcionando corretamente.