Este não é um problema específico do Linux. O Wake-on-lan é implementado pela placa-mãe e pela placa de rede, não pelo sistema operacional. Tente atualizar o BIOS da sua placa-mãe, se puder, e também observe no manual do SN78SH7 :
WOL (PME #) do Soft-Off Se este item for definido como Ativar, a energia do sistema será ligado quando a porta LAN receber um sinal de entrada. Você tem que conectar o fax / modem ao conector Wake On LAN da placa-mãe para esse recurso funcionar. A escolha: ativada ou desativada.
MAC Resume de S4 / S5 Este item permite ativar / desativar o MAC Retomar de S4 / S5. A escolha: desativada ou ativada.
Você precisa ativar essas duas opções. Em particular, MAC Resume de S4 / S5 é necessário para ligar um PC desligado.