A solução mais segura seria usar o dd do live cd. Você precisará fazer o backup da partição MBR e Ubuntu.
Para fazer backup do MBR (primeiros 512 bytes do disco onde o GRUB está instalado), execute:
dd if=/dev/sda of=/backup_dir/mbr_backup bs=512 count=1
Para fazer o backup de sua partição Ubuntu (supondo que seja / dev / sda3):
dd if=/dev/sda3 of=/backup_dir/ubuntu_backup
Não escreva o backup na partição FAT32 porque trunca o backup para cerca de 4 GB. A unidade externa com a partição ext3 ou ntfs seria preferida.
Para restaurar o grub:
dd if=/backup_dir/mbr_backup of=/dev/sda
Para restaurar o Ubuntu:
dd if=/backup_dir/mubuntu_backup of=/dev/sda3