Se você segurar a tecla 'super', que no meu teclado é a tecla Windows, por um segundo você verá uma lista de atalhos de teclado.
Um deles é ctrl + super + D para minimizar todas as janelas abertas, ou seja, para a área de trabalho.
Devido ao debate abaixo, eu me sinto compelido a emendar minha resposta para notar que em alguns sistemas, o atalho pode ser ctrl + alt + D