Eu sugiro que você facilite um pouco a vida criptografando seus diretórios pessoais em vez da partição home, e o ecryptfs seria a melhor ferramenta para fazer isso.
Se você deseja criptografar toda a sua partição home, este artigo mostra como ponto usando LUKS, DM-Crypt e cryptsetup. Eu não posso garantir o desempenho, mas pelo que tenho visto da maioria das soluções Linux, eles são bastante úteis, mesmo em máquinas mais antigas.