O cliente do GitHub para Windows não suporta ter vários controles remotos [1] , que é necessário para sincronizar um repositório bifurcado com um repositório upstream. Você terá que cair para a linha de comando para executar a atualização. O GitHub tem algumas instruções interessantes na documentação deles que resumirei:
Depois de ter seu repositório local, adicione um novo controle remoto "upstream":
git remote add upstream <path to upstream repo>
Agora, busque o repositório upstream para obter as atualizações mais recentes (ainda não mescladas ao repositório local)
git fetch upstream
Agora mesclar nas alterações do upstream
git merge upstream/master