Depois de algumas ótimas ideias do Quack Quixote, eu tentei algumas outras coisas e encontrei uma resposta para essa pergunta. Eu converti o documento do Word para PDF e, em seguida, usando o Illustrator, abri o documento e formatado da maneira que eu precisava e adicionei números de página. Então eu posso salvar de volta em um PDF. Funcionou muito bem e ganhei flexibilidade de formatação adicional.