Podemos descobrir por um experimento simples.
Acabei de criar uma tabela com dois conjuntos de dados e colocar um gráfico abaixo dela com barras de erro. Em seguida, uma tabela dinâmica e um gráfico com base na tabela dinâmica e colocar algumas barras de erro lá também. Como você pode (n't) ver, o gráfico dos dados dinâmicos calcula um desvio padrão de 0. Minha conclusão é que as barras de erro são calculadas nos dados selecionados (assim como @CharlieRB apontou) e não na fonte de dados. os dados selecionados.