O AFAIK IE não suporta vários URLs como parâmetros de linha de comando. Você pode invocá-lo várias vezes com um único URL, cada um a partir de um arquivo em lotes ou algo assim, mas isso parece abrir janelas separadas. Para iniciar vários URLs em guias em uma única janela do IE, use o seguinte script:
var navOpenInBackgroundTab = 0x1000;
var objIE = new ActiveXObject("InternetExplorer.Application");
objIE.Navigate2("http://www.site1.com");
objIE.Navigate2("http://www.site2.com", navOpenInBackgroundTab);
objIE.Navigate2("http://www.site3.com", navOpenInBackgroundTab);
objIE.Visible = true;
Salvar como StartIE.js, clique duas vezes no Windows Explorer ou use wscript.exe StartIE.js
no prompt de comando para iniciar.