Easybcd pode substituir o grub pelo bcd (e pelas cargas elétricas). Você pode então excluir as partições conforme necessário. Eu também ouvi coisas boas sobre editor de bcd visual no chat da SU, mas eu não usei isso sozinho.
Como backup, você também pode criar um disco de recuperação do sistema no menu de backup e restauração do Windows. Este seria um bom momento para fazer o backup do seu sistema Windows, caso algo dê errado também! Você pode usar o disco de recuperação do sistema para corrigir o seu bootloader. A Microsoft tem instruções completas com um vídeo aqui