Eu uso regularmente tal USB Install para o meu trabalho.
Isso permitirá que você mantenha a instalação do disco rígido existente e também poderá comparar os dois em alguma extensão.
Você pode então decidir mudar para 10.04 ou manter a configuração existente (sempre que quiser, enquanto isso, o 10.04 funcionará bem com o flash USB).
Você também pode tentar outros lançamentos ou distribuições dessa maneira antes de fazer a chamada final para instalar.
Lembre-se de que uma instalação USB oferece uma comparação melhor com o seu Ubuntu instalado, em vez de um LiveCD ou LiveUSB.