Eu usaria uma ferramenta freeware como CDBurnerXP ou ImgBurn para simplesmente criar arquivos ISO a partir da unidade. Existem outras ferramentas também, mas você não precisa gastar dinheiro. Veja aqui para uma lista de freeware software de criação ISO .
Não há alternativa real para criar um ISO de qualquer maneira. Se você copiasse os arquivos individuais do disco, teria mais dificuldade em restaurá-los e o risco de erros em arquivos únicos seria muito maior. Se você tem um único arquivo ISO, você pode dar um nome próprio e arquivá-lo.
Depois de criar os arquivos ISO, eu executaria uma ferramenta de verificação de arquivos para criar somas de verificação do DVD ISOs e mantê-los com os arquivos ISO. Dessa forma, você pode certificar-se de que os arquivos estejam intactos quando você os fizer backup em outro local ou transferi-los (como parte de sua programação de backup), antes de restaurá-los em um DVD.