Você deseja um gerenciador de arquivos alternativo, também conhecido como um substituto do Explorer. Alguns deles assumirão as operações de abertura de pastas, para que as pastas de clique duplo abram o gerenciador de arquivos. por exemplo. Diretório Opus e xplorer2 são dois que eu conheço que fazem isso, provavelmente há outros.
No entanto, as caixas de diálogo da shell nos programas (Abrir / Salvar) ainda serão controladas pelo Explorer. É realmente mais preciso dizer que o Explorer é um verniz relativamente fino sobre as habilidades de gerenciamento de arquivos do shell. Ele também fornece a área de trabalho e a barra de tarefas, mas as habilidades de gerenciamento de arquivos vêm principalmente de outros componentes do sistema. O Explorer não os fornece para o resto do sistema.
É por isso que eles são tão difíceis de anular; para modificar strongmente esses componentes requer mexer muito profundo no Windows com ramificações para cada aplicativo não-trivial. Especialmente desde que essas DLLs são carregadas no espaço de memória desses processos, estragar um mod potencialmente desestabiliza quase todos os aplicativos voltados para o usuário.