As compilações noturnas são as versões mais recentes que passam por qualquer tipo de teste que o desenvolvimento do projeto tenha configurado. Eles contêm os recursos mais recentes, mas também podem ser instáveis.
Em um ambiente de produção, você provavelmente não deve executar compilações noturnas de nada. A última versão será muito mais estável e terá testes muito melhores. Só execute as compilações noturnas se elas tiverem um recurso que você absolutamente precise executar sua missão e certifique-se de testar o sistema extensivamente para garantir que não haja problemas.