Eu encontrei a resposta. Opções > > Opções do painel > > Misture todos os arquivos
Por padrão, o mc ordena para que os diretórios fiquem no topo (antes dos arquivos). De alguma forma, eu mudei isso para que os diretórios sejam classificados em ordem alfabética. Onde está a opção ou o atalho de teclado para mudar isso?