Você pode exportar marcadores no Adobe Audition CC, conforme mostrado abaixo. CS6 e versões mais antigas não parecem ter a capacidade de exportar ou importar marcadores.
Selecione os marcadores que você deseja exportar ( Ctrl + A para todos), clique com o botão direito do mouse em uma área vazia do painel de marcadores e clique em "Exportar marcadores selecionados". Ele será exportado como um arquivo CSV delimitado por tabulações.
Você também pode importar marcadores usando a opção "Importar marcadores do arquivo".