Eu não acho que isso seja possível. O pessoal do Panic tem um excelente suporte, pode haver uma preferência oculta por isso, mas eu não encontrei nada.
O Coda é construído em torno de Sites / Projetos, e somente esses permitem que você defina um diretório local.
Como solução alternativa, você pode criar "Sites" que somente especificam o Local Root . Quando você abre um desses sites após a inicialização, a única coisa que acontece é que o diretório local é alterado.
