Eu tive o mesmo problema com o Safari nos últimos meses. A barra de ferramentas (que inclui barra de endereços, pesquisa no google, botões, etc) estava oculta quase toda vez que eu relançava o Safari mesmo que a barra de ferramentas estivesse visível antes de sair (eu seleciono manualmente mostrar barra de ferramentas no menu Exibir). Tentei redefinir o padrão na opção de personalização da barra de ferramentas. Eu destruí as prefs. Eu até mesmo destruí o Safari e sua biblioteca e depois reinstalei uma nova cópia. A barra de ferramentas ainda permanecia oculta a maior parte do tempo, a menos que eu a solicitasse manualmente para ser mostrada com o item de menu "Visualizar .." (e depois ficaria oculto no próximo relançamento).
Agora, finalmente !, acho que encontrei a solução. Com a barra de ferramentas visível (selecione Mostrar barra de ferramentas no menu Exibir), mantenha pressionado o botão direito sobre a área da barra de ferramentas para exibir um menu contextual. Selecione "Manter visível" nesse menu.
Parece que este é um semi-bug no Safari, pessoal. Se o usuário selecionar a barra de ferramentas para ficar visível por padrão usando o menu de personalização, a barra de ferramentas deverá ser mantida visível. Para alguns de nós, isso não está acontecendo, a menos que também selecione "Manter visível" no menu contextual da barra de ferramentas.
EDIT (no dia seguinte): Desculpe pelo acima. Ainda está tendo problemas com uma barra de ferramentas que está desaparecendo. A menos que eu esteja perdendo um botão oculto em algum lugar, parece que isso pode ser uma falha do Safari que afeta apenas algumas pessoas. Talvez uma janela automática sem barra de ferramentas que apareceu no passado alterasse permanentemente as partes internas do Safari que os usuários não podem alterar novamente?