Você pode montar seu diretório local no contêiner e depois executá-lo quase como se estivesse em sua máquina local. Por exemplo:
docker run --rm -v "$PWD":/app -w /app iron/python:2 python hello.py
Isso monta seu diretório atual e executa hello.py a partir desse diretório.
Você pode encontrar exemplos completos disso aqui: link