Esta parece ser uma extensão muito boa para o Firefox que faz o que você quer. link
Ele adiciona um pequeno ícone entre o campo de URL e o campo de pesquisa no firefox. Quando você clicar nele, poderá iniciar uma verificação de todos os seus favoritos.
Descrição de addons.mozilla
Bookmarks Checker. Scan favorites for broken or dead links. Delete empty, and duplicate folders.
Check bookmarks for broken or dead/broken links.
Add bookmarks that you do not want to be scanned to ignore list.
Scans for 404 bookmarks, Time-out links or 403 favorites.
Scan for duplicate folders.
Scan for empty folders.
Scan in several threads.
Set timeout setting for bookmarks