Existem muitas maneiras de fazer isso com um script, mas o Python é uma linguagem versátil e funciona em praticamente todas as plataformas.
E esta é uma biblioteca que você pode usar para ler arquivos em pdf . Existem algumas bibliotecas em PDF, no entanto.
Você pode até mesmo fazer isso sem uma biblioteca de PDF, lendo o arquivo diretamente.
Se você não estiver familiarizado recentemente com a redação de scripts, você chegará mais rápido com alguma ajuda, mas se quiser experimentar, as principais áreas em que deseja focar são:
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Lendo argumentos da linha de comando (assim você pode passar o nome do arquivo quer mudar)
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Abrindo, lendo e fechando arquivos
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Abrindo, lendo e fechando arquivos com a biblioteca PDF
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Manipulação de strings - substrings e strings de divisão podem ser necessários
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Usando as chamadas do sistema para renomear um arquivo