Isso realmente se resume à sua configuração, mas aqui estão alguns
Mantenha seus discos de instalação à mão e tenha uma cópia eletrônica (uma iso rasgada com imgburn) por exemplo. O mesmo acontece com todo o seu software - tenha sempre pelo menos duas cópias ou mais. Os discos se perdem, os discos rígidos morrem.
Os backups não são apenas uma boa idéia, eles podem salvar seu hide - com o windows 7 ou melhor, use os backups internos, use macrium reflect free ou acronis for windows. Para o OS X, eu sou informado que cloner de cópia de carbono é bom. Para sistemas Linux, isso dependeria - eu uso remastersys no Ubuntu Box, e provavelmente usaria mondo / mindi em sistemas onde funcionaria
manter sistemas atualizados - onde há sistemas Windows onde rotina, atualização padrão não é uma opção eu uso o atualizador off-line do wsus
Nunca NUNCA execute uma conta de administrador para uso diário.
Padronize o software - isso se torna mais fácil porque um bom número de ferramentas que eu uso no Windows é de código aberto ou gratuito, e pode ser instalado via ninite - isso significa que é mais fácil rastrear problemas, já que você não está gerenciando configurações diferentes.
Para PDFs, eu uso sumatra ou pdfxchange viewer (atente no instalador do pdfxchange para a barra de ferramentas de tarefas irritantes e desligue-a). Sumatra é básica, leve e sem problemas, enquanto o pdfxchange é um pouco mais cheio de recursos