Este é um bug que foi corrigido em dpkg 1.10.21 (ou seja, em vez de morrer com um erro fatal, um aviso é emitido, pois esse arquivo de configuração é opcional). Se você não puder consertar o erro de permissão, atualizando o dpkg deve mitigar o problema. Como você precisará executar o dpkg para atualizar-se, talvez seja necessário desmontar a home do nfs para isso.