clamav ainda é disponível nos repositórios . Basta instalá-lo via sudo apt-get install clamav .
Parece que o (s) centro (s) de software (s) [especialmente gnome-software] não mostram todos os pacotes - acredito que ele realmente só mostra pacotes com interfaces gráficas de usuário.
ClamTK é um front-end gráfico para o ClamAV e puxa os pacotes necessários como clamav na instalação.
Se você quiser um gerenciador gráfico de pacotes "old-school" completo, recomendo que vá com o Synaptic .