Eu não tenho conhecimento específico sobre o Windows 10 (mas estou usando matrizes RAID por muito tempo).
Você definitivamente não deveria estar tentando ESCREVER dados para um disco na matriz quando não está montado - não pode terminar bem. Os dados certamente não serão RAIDED quando o sistema for restaurado e causarão inconsistências e possivelmente corrupção.
Ignorando sistemas de arquivos avançados como ZFS e BTRFS, os sistemas de arquivos esperam ser consistentes quando escritos - e os seus não serão.
Parte do problema é que a matriz RAID não saberá quais blocos foram modificados - no caso de o arquivo chegar, isso significa que não será espelhado, mas o que mais me preocuparia seria a divergência de informações na tabela de alocação de arquivos ou equivalente - ou seja, o registro que aponta para onde os arquivos estão.
Como melhor cenário, se eu estivesse desesperado (e eu não recomendo que você faça isso sem um backup), eu copiaria o arquivo em 1 disco, inicializaria o sistema com apenas 1 disco, marcaria o array como ruim e depois reconstruí-lo.