Eu não posso falar sobre as diferenças de recursos. (Até onde eu sei, não há nenhuma diferença de recursos, exceto pelas mudanças óbvias na interface do usuário, e as coisas de segurança / sandbox que a maioria dos usuários não precisa se preocupar.) Mas, em relação à "sincronização" entre o dois:
- As configurações que afetam todo o sistema, como as configurações de conexão, são as mesmas para ambos
- As configurações que afetam apenas o Internet Explorer, como as preferências de guias, os cookies ou as guias abertas em uma sessão, não são sincronizadas entre os dois
Geralmente eu sugiro escolher um e usá-lo consistentemente. Se você conhece os gestos do Windows 8 e / ou possui uma tela sensível ao toque, sugiro a versão RT. Mas se você estiver no modo Desktop na maioria das vezes, talvez a interface de usuário antiga seja a melhor escolha.
(Lembre-se, você pode encaixar a versão "RT" para que ela não fique em tela cheia. Portanto, isso não deve ser um motivo significativo para escolher uma sobre a outra.)