Você precisa se decidir:
- Você pode formatar o disco como FAT32. Dessa forma, você não pode manipular arquivos > 4GB. Mas vai funcionar em ambos os sistemas e é rápido.
- Você poderia usar o NTFS. Mas você terá que instalar o ntfs3g para poder escrever a partir do Mac. ntfs3g é um pouco lento (última vez que verifiquei, há 4 meses).
- existem outras opções (ext2 / 3, ...), mas elas exigem software instável ou não fácil de usar em uma ou nas duas máquinas.
Eu ficaria com o NTFS.
[editar] limite de tamanho do fat32 corrigido (4 em vez de 2 GB)
[editar] Desde o OS X 10.6.5, existe outra opção: o extFAT. É suportado pelas versões modernas do Windows e OS X. Contra: É proprietário e não suportado em todos os sistemas operacionais modernos (Linux ...) e algumas versões não tão recentes do Windows e do OS X. Pro: Funciona muito bem em mainstream main-OSes (ou seja, Windows e OS X)