Após um pouco de pesquisa seguindo o comentário de Fabby - usei o seguinte comando, que funcionou:
gsettings set org.gnome.desktop.wm.preferences mouse-button-modifier '<Super>'
Agora é a super tecla que abre o menu da janela.
Após um pouco de pesquisa seguindo o comentário de Fabby - usei o seguinte comando, que funcionou:
gsettings set org.gnome.desktop.wm.preferences mouse-button-modifier '<Super>'
Agora é a super tecla que abre o menu da janela.