O sistema de área de transferência do X11 é implementado usando três tipos de "seleções": 'primary', 'secondary' e 'clipboard'. 'Clipboard' é usado para os menus "Copy / Paste" e ctrl + c / v, e o primário é usado para seleção de mouse e pasta do botão do meio do mouse; 'secundário' é uma área pouco usada, como backup para 'primário'.
A especificação da área de transferência do freedesktop.org explica o seguinte sobre a seleção PRINCIPAL:
1.It's inconsistent with Mac/Windows;
2.It's confusingly. Selecting anything overwrites the clipboard;
Portanto, parece que, como a seleção Primária sobrescreve a seleção da Área de Transferência, você nunca pode sobrescrever com eficiência um bloco de texto na máquina remota com um bloco de texto selecionado na máquina host (após a segunda seleção ser feita) primário), substitui a primeira seleção (na área de transferência)).
A resposta para a pergunta é provavelmente "Não", a menos que as especificações vinculadas estejam desatualizadas (elas são de 2001), ou há alguma substituição a esse comportamento que não consegui encontrar.