Como o Explorer.exe faz parte do sistema operacional Windows, eu esperaria encontrar erros e mensagens a respeito dele no System, mas, assim como você, eu também verificaria o Application, porque o Explorer.exe pode não ser o único a ser lançado o erro e só pode estar passando algo.
Não deve ser necessário verificar outras pastas no Visualizador de Eventos, a menos que você tenha criado visualizações e filtros personalizados.
A pasta Applications and Service Logs contém registros e eventos de hardware específicos para aplicativos e serviços e geralmente é útil para diagnósticos mais direcionados.