Você executou svnadmin repair [path to repo] ?
Verifique se há arquivos ausentes ou danificados. Se você estiver executando no Windows, verifique se o arquivo está no formato UNIX ( \n ) e não no formato do Windows ( \n\r ).
No pior dos casos, copie em um arquivo de substituição. Ele funciona para revprops (arquivos de comentários), não tentei por revs (arquivos de dados).