Eu estou querendo saber se você pode ter conexão de firewire ruim. Seria possível conectar a unidade via USB (pode ser necessário usar um adaptador USB Firewire- >). Se funcionasse dessa forma, eu imaginaria que você tem algo errado com o firewire no seu computador (a menos que você tenha outros dispositivos firewire que funcionem bem além do disco rígido).
Esqueci de perguntar ... existe algum problema com a conexão da unidade após a inicialização? Se não houver nenhum problema dessa forma, talvez seja necessário examinar sua BIOS e ver se existe algum tipo de conflito de ordem de inicialização (improvável, pois está chegando parcialmente ao Windows).