Parece depender da aplicação. Agora mesmo, com 10.6.4:
- O diálogo de exportação do iCal foi iniciado em qualquer pasta que usei da última vez;
- O Safari e o Firefox parecem começar com
~/Desktop
; - O NeoOffice começou com
~/Documents
; - O console começou com
~/Library/Logs
.
Portanto, não tenho certeza se existe algum padrão do sistema. cada aplicativo parece ter sua própria idéia de onde você provavelmente deseja salvar um arquivo.