Existem basicamente duas razões pelas quais as empresas demoram a mudar: dinheiro e poder.
Dinheiro: o IE está lá, os funcionários estão familiarizados com ele e foram testados em relação aos aplicativos importantes para os negócios. Qualquer mudança nesse status quo custará algo - tempo, esforço, testes, treinamento, etc, sem mencionar as mudanças no aplicativo que seriam necessárias para suportar plataformas de navegador mais modernas. Se você fizer uma análise de custo / benefício, o que você obterá com esse custo? Vale a pena? Obviamente, para muitas empresas, não é.
Potência: as configurações do IE podem ser controladas centralmente. Outros navegadores, não tanto. A maioria dessas configurações está relacionada a # 1 (Money): impedindo que você faça coisas que possam desperdiçar recursos da empresa, comprometer a segurança da empresa, etc.
As grandes empresas parecem se importar com pouco mais que o resultado final. Se eles pudessem melhorar a rentabilidade voltando às telas verdes para todos, seu PC estaria ausente amanhã.