Se você puder pagar - vá para VMWare Workstation . É rápido, estável e afeta o sistema operacional no mínimo.
Se você quiser de graça, então vá para Virtualbox . Não é tão polido, mas ainda é rápido e estável.
No entanto, lembre-se de que você está essencialmente executando um computador em um computador. Seu SO host será afetado definitivamente pelo uso do processador da VM, operações de disco i / o e uso da memória. Nenhum software de VM reduzirá isso significativamente para você.
Dito isto, se você realmente se importa com o desempenho do sistema operacional host - a primeira coisa a fazer é ajustar suas VM's para o mínimo de E / S de disco e obter mais RAM para o seu sistema.
EDIT: OP deseja um software de VM que literalmente não afeta o sistema quando as VMs não estão em execução.
Nesse caso, recomendo que você escolha o Portableboxbox . É portátil, é autônomo e, por ser independente, não despeja lixo em todo o seu sistema. Se você não está rodando, seu sistema operacional não deve ser afetado por nada também. Dê uma chance.