Em resposta à edição da pergunta:
Sem espaço livre de qualquer tipo, o sistema é rapidamente inutilizável. Você não pode salvar o trabalho em qualquer aplicativo, vários aplicativos falharão porque fazem cálculos com o disco, etc. Você não pode usar de forma confiável apenas um navegador da Web, porque você não seria capaz de consertá-lo no evento bugs são descobertos (o que eles são invariavelmente).
Poucas tarefas no computador serão bem-sucedidas / fazem sentido se ninguém puder salvar nada;)
Por "Na partição do sistema", presumo que você tenha alguma outra partição que tenha espaço livre. Qualquer sistema sem qualquer espaço livre no disco torna-se rapidamente inutilizável.
Diretamente , a pior coisa que pode acontecer por ter um disco de sistema completo é a falha do sistema em salvar minidespejos em telas azuis da morte.
Indiretamente , no entanto, há um problema maior. Vários aplicativos, quando se instalam, tentam instalar DLLs em% WINDIR% \ System32, mesmo que eles não devam colocar nada lá. Qualquer programa que fizer isso falhará na instalação, porque (é claro), o disco no qual a pasta está armazenada está cheio.
Isso também faz coisas como o Windows Update, ou qualquer outro tipo de atualização ou instalação, porque eles geralmente tentam gravar na unidade do sistema ou pelo menos usar a unidade do sistema como um local temporário.
Portanto, embora o Windows não deva falhar como resultado de um disco de sistema completo, há muitos aplicativos que falharão. Portanto, provavelmente não é uma boa ideia.