O pen drive USB é USB3? Esse erro é encontrado quando você tenta inicializar o Windows 7/8 a partir de uma porta USB3 porque ele não tem os drivers carregados para passar da parte da instalação, onde ele solicita que você selecione o disco para o qual instalar. Tem certeza que você usou uma porta USB2 também? Você tem algum dispositivo ligado ao barramento USB em todos os outros que não o thumbdrive? Eu pude ver isso causando problemas durante a instalação também.