Sim, você pode fazer isso. Se você tem dois programas, a saber, prog1 e prog2, então tente isto:
#!/bin/bash
prog1 2> .errorprog1.log & prog2 2> .errorprog2.log &
Isso redirecionará o erro para separar os registros.
Você também pode tentar isso:
prog1 &
prog2 &
Eu encontrei este thread , que contém muitas dicas úteis que serão benéficas para você. Por favor, passe por isso.
Espero que isso ajude.
Obrigado.