Você pode usar o wget: crie um arquivo simples com a lista do URL que você precisa baixar (por exemplo, pippo.txt):
pippo.txt:
http://url1.zip
http://url2.htm
http://url3/
ftp://url4/file.zip
Em seguida, use o wget para fazer o download da lista de URLs:
cd /some/folder/
wget -i /path/to/pippo.txt
Concluído
wget for linux é uma ferramenta básica link Para Windows, há uma porta bin: link