A menos que o Antivírus esteja ciente do simlink, o link simbólico aparecerá como outra pasta. Então, o comportamento padrão seria varrer a pasta.
O problema comum que os links simbólicos (e as pastas com link físico) apresentam o software de digitalização não é se ele detectará o link. Parece com qualquer outra pasta. O problema comum apresentado ao software de digitalização é devido ao fato de que os links simbólicos, juntamente com uma hierarquia de pastas mal projetada, podem criar um loop. Como eles se parecem com qualquer outra pasta, o software de digitalização não tem idéia de que está passando pelas mesmas pastas repetidas vezes.