Instalar o cron-apt:
sudo apt-get install cron-apt
Editar arquivo de configuração:
sudo gedit /etc/cron.d/cron-apt
comente a linha: (coloque '#' na frente dela)
0 0 * * * root test -x /usr/sbin/cron-apt && /usr/sbin/cron-apt
Adicione estas linhas ao final do arquivo:
Todos os dias (meia-noite)
0 0 * * * root test -x /usr/sbin/cron-apt && /usr/sbin/cron-apt
Salve o arquivo.
Para mais informações, consulte: link