Uma alta porcentagem de uso da CPU não deve ser prejudicial, já que as CPUs não têm partes móveis, que se degradam após uma certa quantidade de uso.
Teoricamente, poderia, mas eu ainda estou para ver uma CPU com falha por causa do alto uso. (Você pode até mesmo usá-los com segurança 24 horas por dia, 7 dias por semana e 365 dias por ano).
O calor é outro problema que reduzirá a vida útil da CPU. (Outro é overclocking.) Ele se correlaciona com o uso e quanto mais calor é produzido, menor a vida útil.
Mas, novamente, o resfriamento apropriado que mantém as temperaturas na "região intermediária" da faixa de especificação possibilitará o uso contínuo.
Na minha opinião, tudo se resume a isso: se você puder manter a temperatura baixa, a porcentagem do uso não importa .