Sua unidade não está sendo detectada como uma "unidade USB", é um dispositivo com conexão automática ativada (que também são dispositivos USB). Você pode desconectar o disco rígido removendo-o com segurança e desconectando-o enquanto o computador estiver ligado.
Minha placa principal permite que eu ligue e desligue para portas SATA individuais. Alguns têm um interruptor mestre para todo o controlador SATA, e outros ainda não permitem que você o comute. Neste último caso, você pode, às vezes, alternar seus drivers do controlador SATA para desativar o recurso, mas na verdade não está prejudicando nada para ativá-lo. O Windows não permite que você desmonte sua unidade do sistema porque há muitos arquivos importantes abertos e bloqueados.