Vá para AdBlock Plus > Opções > Personalizar e clicar no botão editar ao lado de Editar manualmente seus filtros .
Aqui você pode adicionar isso como uma nova linha:
@@file:///|$document
Isso criará uma exceção para todos os URLs que começam com o protocolo file://
, portanto, para todos os seus arquivos locais.
Veja Escrevendo filtros do AdBlock Plus para mais explicações.