ffmpeg -i input.mkv -i audio.dts -map 0 -map 1 -c copy output.mkv
O comportamento padrão seleção de fluxo escolhe apenas um fluxo por tipo de fluxo, portanto, nesse caso, você precisa usar -map para informar quais fluxos você deseja.
O índice do arquivo de entrada começa a contar a partir de 0, portanto, usar -map 0 escolherá todos os fluxos da primeira entrada ( input.mkv ) e -map 1 escolherá todos os fluxos da segunda entrada ( audio.dts ). / p>
O resultado é que output.mkv conterá todos os fluxos de ambas as entradas. Usar -c copy transmitir cópia dos fluxos, para que eles sejam simplesmente re-alterados sem recodificação adicional.