Como foi mencionado anteriormente, uma vez que você acredita que seu PC foi comprometido, é difícil ter 100% de certeza de que você encontrou e removeu tudo. Mesmo que você tenha limpado todos os arquivos, ainda é possível que ainda exista uma vulnerabilidade no sistema que permita que ele seja comprometido novamente.
Dito isto, existem ferramentas online úteis para ajudar a determinar se o seu PC está comprometido. Eu começaria com as ferramentas gratuitas oferecidas pela Trend Micro:
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O HijackThis é um pouco técnico, mas examinará seu arquivo de hosts, examinará seus Objetos auxiliares do navegador e inspecionará outros vetores comuns que fazem com que seu navegador exiba conteúdo indesejado.
Outra opção é usar um CD de recuperação para verificar se há vírus no seu sistema. Eu pessoalmente usei o seguinte da F-Secure e encontrei um bom sucesso:
Se você usar o CD de recuperação da F-Secure, precisará baixar o arquivo .zip, extrair o arquivo de imagem .iso e gravá-lo em um CD. Em seguida, inicialize seu PC pelo CD e siga as instruções. O programa antivírus tentará baixar os arquivos de definição de vírus mais recentes da Internet antes de digitalizar seu PC.