Há uma tonelada de pessoas por aí. O problema com os 'automáticos' é que eles fazem 'checagem de silêncio' para determinar quando uma música termina e a próxima começa.
Como muitas músicas têm partes 'silenciosas' nelas, você geralmente precisa verificar manualmente tudo no final de qualquer forma.
Dito isto, o programa que uso para todas as minhas necessidades de edição de áudio é o Audacity . É gratuito, de código aberto e de plataforma cruzada.
Ele tem verificação de silêncio, assim como outras ferramentas para ajudá-lo a dividir grandes MP3s em trilhas individuais. Aqui está um link para o artigo da Wiki sobre o assunto . Além disso, tudo que você precisa para consertar o que as coisas 'automáticas' bagunçam. ;)