Quando a ConEmu perde o foco, isso se dá:
Paraisso:
Não consegui encontrar nenhuma configuração de foco relevante. Como posso evitar esse comportamento?
ConEmu 161206 [64] {Stable}
Você deve desativar a opção Fade when inactive na guia Features -> Colors das configurações.
Fade when inactive
Features -> Colors
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